Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP36Q9P275 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms