Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABRACLQ9P1F3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms