Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSD3Q9NYI0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms