Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms