Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms