Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms