Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms