Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms