Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CMC2Q9NRP2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms