Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms