Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms