Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms