Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms