Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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BPESC1Q9GZL8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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BPESC1Q9GZL8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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BPESC1Q9GZL8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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BPESC1Q9GZL8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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BPESC1Q9GZL8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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BPESC1Q9GZL8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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BPESC1Q9GZL8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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BPESC1Q9GZL8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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BPESC1Q9GZL8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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BPESC1Q9GZL8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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