Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CCSER1Q9C0I3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms