Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRCC1Q9C099 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms