Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC2Q9BYS8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms