Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms