Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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