Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms