Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUE6

ISCA1, Iron-sulfur cluster assembly 1 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISCA1Q9BUE6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ISCA1Q9BUE6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ISCA1Q9BUE6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms