Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPOQ9BU64 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms