Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms