Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM29Q9BSF4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms