Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCAF11Q99590 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms