Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms