Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms