Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms