Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms