Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MVB12AQ96EY5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MVB12AQ96EY5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms