Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms