Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TRIM63Q969Q1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TRIM63Q969Q1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TRIM63Q969Q1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TRIM63Q969Q1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TRIM63Q969Q1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TRIM63Q969Q1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TRIM63Q969Q1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TRIM63Q969Q1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TRIM63Q969Q1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TRIM63Q969Q1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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