Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms