Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms