Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ZNF439Q8NDP4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ZNF439Q8NDP4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ZNF439Q8NDP4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF439Q8NDP4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF439Q8NDP4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF439Q8NDP4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF439Q8NDP4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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