Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71E2Q8N5Q1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms