Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms