Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms