Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms