Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms