Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms