Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GGNBP1Q5YKI7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GGNBP1Q5YKI7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms