Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP350Q5VT06 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP350Q5VT06 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms