Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGSNQ5TDP6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGSNQ5TDP6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGSNQ5TDP6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGSNQ5TDP6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGSNQ5TDP6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGSNQ5TDP6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGSNQ5TDP6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGSNQ5TDP6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGSNQ5TDP6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LGSNQ5TDP6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGSNQ5TDP6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGSNQ5TDP6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGSNQ5TDP6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGSNQ5TDP6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGSNQ5TDP6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGSNQ5TDP6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms