Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms