Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms