Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEXMIFQ5QGS0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms