Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q499Y3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Q499Y3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q499Y3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q499Y3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q499Y3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q499Y3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q499Y3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q499Y3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q499Y3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q499Y3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q499Y3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q499Y3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q499Y3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q499Y3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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