Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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