Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms